| 用語 |
意味 |
| GeneOntology |
国際的なコンソーシアムGene Ontology Consortiumが開発している遺伝子注釈用語集。遺伝子の機能や生物学的プロセス、細胞内局在について、個々の遺伝子に統一的な用語で注釈を与えることを開発がすすめられている。
http://www.godatabase.org/cgi-bin/amigo/go.cgi |
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MEDLINE |
医学分野で世界最大の文献データベース。1966年からNLM（米国国立医学図書館）でデータ収集が始まり，現在毎月約3万件の文献が新たに追加されている。現在では，米国を中心に約70ヵ国から，900万件を超える文献が収録されている。英語以外の文献も英訳されて登録されている。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&
cmd=search&term= |
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MR |
Medical Representativeの頭文字をとったもので、日本語では医薬情報担当者と訳す。医薬品メーカーの医薬情報担当者のことを意味する。どの病気にどの位の量をどのように使えば効果があるのか。その際、どのような副作用が起こりうるのか、また、新たに発生した副作用情報、追加になった適応症の情報などを、病院や医師、薬剤師に提供する。 |
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XQuery |
XQueryは非構造化データであるXMLに対して、構造化データである関係データベースにおける標準的な問い合わせ言語SQLと同等の機能を持つ問い合わせ言語である。複雑な検索やXMLドキュメントの結合を行うことができる。WWWで利用される技術の標準化をすすめる団体W3Cで標準化された。 |
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エッジ |
エッジとはネットワークを構成する2つの要素のうちの1つである(もうひとつはノード)。ノードとノードをつなぐものがエッジである。本システムのネットワーク図では、Ｅ関係を示す。 |
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オントロジ |
概念と概念のあいだの関係を明確に記述したもの。生命科学では、これまで研究者の脳の中に構築されてきた知識をコンピュータが自由に利用できるようにすることで、膨大な知識の整理と発見の支援が期待されている。 |
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概念 |
特定の分野で対象となるモノや現象のこと。 |
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ゲノム創薬 |
従来の創薬は、薬の候補となる化合物に対して網羅的な実験を行ない効果がある疾患を発見していた。ゲノム創薬では、遺伝子配列の解析結果などから疾患の原因となっている遺伝子を見つけだし、その遺伝子に対して効果がある化合物を遺伝子が産出するタンパク質の構造などから見つけだす。このことにより従来にない薬を発見することが期待されている。 |
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細胞内局在 |
遺伝子がどの細胞内のどの部分で機能を発現しているかということ。 |
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作用機序 |
薬が生体内でどのような機能を果たし、どのように作用を起こすのかという仕組みのこと。 |
自然言語処理
(NLP = Natural Language Processing) |
人間が日常的に使う言葉をコンピュータによって処理させるための技術。代表的なものに機械翻訳がある。 |
上位下位関係
（is_a 関係） |
A is a Bと言いあらわせる関係のこと。例えば、「動物」と「犬」のあいだには上位「動物」下位「犬」という関係がある(Dog is a animal)。 |
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情報抽出 |
自然言語処理技術を使って、あらかじめ指定しておいた概念や概念が関わる事象、概念のあいだの関係などを文章から自動的に抽出し、表などの整理した形式で出力する技術。 |
バイオインフォ
マティクス |
情報科学的手法によって生命科学の問題を解決することを目的とする学問分野のこと。遺伝子のDNA配列の類似度から遺伝子の機能を予測したり、配列の統計的な性質から遺伝子領域を予測するなどがこれまで代表的な成果である。「生命情報学」「生物情報学」などと訳されることもある。 |
部分全体関係
（part_of 関係） |
A is part of Bと言いあらわせる関係のこと。例えば、「腕」と「人間」のあいだには全体「人間」部分「腕」という関係がある(Arm is a part of man)。 |
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テーラーメード医療 |
各個人の持つ遺伝子の違いから各個人の体質や病状の違いを分析し、最適な薬を投与することも目的とする医療。 |
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テキストマイニング |
厳密な定義はなく、データベース中の大量のデータから有用な知識を発見する手法データマイニングからアナロジカルにつけられた名称。大量のテキストデータを使って、役に立つ知識や情報を見つけ出す手法を指す。 |
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ノード |
ノードとはネットワークを構成する2つの要素のうちの1つである(もうひとつはエッジ)。エッジの結節点がノードである。本システムのネットワーク図では、概念を示す。 |
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リード化合物 |
薬としての活性が明かになっている、薬の候補となる化合物。この化合物を基本構造として科学的な修飾をほどこすことで実際に利用可能な薬を開発する。 |
MeSH
（Medical Subject Headings） |
アメリカ国立医学図書館が提供する文献データベースMEDLINEの索引用用語集。数万語規模であり、かつ、木構造に用語が整理されている。ただし、索引用のため、個々の物質名などまでは十分に登録されていない。
http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html |
UMLS
（Universal Medical Language System） |
アメリカ国立医学図書館が提供する医学生物学向け用語集。200万語を超える膨大は用語を登録している。ただし、内容はあまり整理されていない。
http://umlsinfo.nlm.nih.gov/ |
GENA
（Gene Name Dictionary） |
東京大学高木研究室が提供する遺伝子名辞書。
http://gena.ontology.ims.u-tokyo.ac.jp:8081/search/servlet/gena |
